hallo swissSL
Ich habe so in etwa das gleiche Problem.
Bei mir sind 3 Ordner betroffen, die nicht gelöscht werden wollten. Nun denn, es geht mit etwas Arbeit:
Bei mir sah es wie folgt im WebMail aus:

Die Ordner Drafts/Entwürfe, Sent/Sent und Trash/Papierkorb sind doppelt. Alles was in Outlook passierte, wurde in die Ordner unter Meine Ordner synchronisiert und was im WebMail passierte wurde in den oberen Ordnern abgelegt.
Die IMAP-Ordner konnten weder gelöscht noch deaktiviert werden:

Gehe nun im WebMail in die Einstellungen und zum Reiter Konten hinter der E-Mail-Adresse steht Bearbeiten.
Danach sollte dies zu sehen sein:

Ändere die Zuordnung der einzelnen Ordner, wähle das Dublikat welches nicht gelöscht werden konnte. Bei mir sah es danach so aus:

Nun konnte ich im WebMail die unter Meine Ordner aufgelisteten Ordner löschen und entfernen. Achtung! vor dem Löschen der Ordner die enthaltenen Dateien in die anderen Ordner verschieben, sonst ist der Inhalt weg!

Und bei den abonnierten IMAP-Ordnern sieht es danach so aus:

Einziger Wehrmutstropfen, die Ordner werden in Outlook und im WebMail in englischer Sprache angezeigt.. zumindest sind sie nicht mehr doppelt vorhanden.